1937年12月13日，南京城沉浸在战火之中，侵华日军攻占了这座曾是国民政府首都的城市。尽管部分官员选择弃城逃亡，但仍有坚定的官兵留守，誓死捍卫这个岌岌可危的城池。电影《南京！南京！》通过讲述这段历史，展现了官兵们微弱而顽强的抵抗精神

影片聚焦于宋希濂部军官陆剑雄（刘烨饰）及其战友，在日军的进攻下，他们勇敢地展开了激烈的巷战。尽管抵抗力量微不足道，但他们的决心却坚如磐石。然而，最终，他们的抵抗还是被日军所压制，数以万计的中国军民成为了俘虏，长江边的土地被鲜血染红。

在抵抗最终失败之后，南京城成为了死亡的象征。数十万的中国军民遭受了残酷的屠杀，南京沦为一片人间地狱。唯一的生存希望存在于金陵女子学院的“安全区”。大量的难民聚集在这里，寻求生的一线希望。

“安全区”的存在离不开南京安全区国际委员会主席拉贝、归国女教师姜淑云（高圆圆饰）、金陵女子学院的魏特琳女士等人的坚韧与勇气。他们积极营救中国难民，用自己的行动对抗日军的残忍。然而，日军的野蛮已经到达了极点，他们盯上了藏身于“安全区”的中国妇女，使这一片曾经的避风港成为了魔鬼的领地。