故事的女主人公方若瑄（宋睿饰）在幼年时曾在家里的老宅子遇到一场事故，导致她失去了童年的记忆，并被送到国外生活。然而，当她成年后，她的父亲去世，遗愿让她携父亲的骨灰回到祖国。回国后，她再次回到了曾经家里的老宅子，却发现这里已经变成了一所医学院。唯一保留下来的是一口枯竭的玲珑井，它仿佛是过去的见证者。

方若瑄发现，每当她走到玲珑井前，脑海中就会闪过一些模糊的记忆碎片，这让她产生了一种强烈的好奇心。她决定在医学院借读，以便更深入地了解这口井。在学校里，她结识了学生陈博飞（王良饰），两人之间很快产生了深厚的感情。

然而，方若瑄回到学校后，却遭遇了一系列诡异的事件，得知曾经有一名女学生在此跳井自杀。她开始怀疑这些事件与自己失去的记忆有某种联系。更令她担忧的是，她的男友陈博飞突然失踪。方若瑄四处寻找陈博飞，但未能找到，而是在他的家里找到了一本日记。日记内容引发了她失去的记忆，一切似乎都开始慢慢浮现。

失落的记忆、陈博飞的失踪、跳井女学生的死亡，一切线索都指向了老宅子中的玲珑井。方若瑄下定决心亲自下去一探究竟，揭开了一个隐藏在时光深处的谜团。